تزوج مارادونا صديقته كلاوديا فيلافان عام 1984 ولهما ابنتان: دالما وجانينيا، ‏قبل طلاقهما عام 2004. ‏
ولديه ولد اسمه دييغو جونيور ولد في نابولي عام 1986، وقد اعترف بأبوته فقط ‏في 2004‏‎.‎ وكان دييجو مدافعا شرسًا عن الزعيم الكوبي الراحل فيدل كاسترو، وظهر وشم ‏الأخير بشكل واضح على كتفه، كما كان من أنصار الزعيم الفنزويلي هوغو ‏تشافيس‎.‎